Podporne funkcije, funkcije in primeri

The podpira So neaktivne oblike encimov, to so encimi, ki nimajo njihovih kofaktorjev ali koencimov, ki so bistveni za izvajanje katalitičnih reakcij, katerih na voljo so.

Encimi so beljakovine s katalitično aktivnostjo. Njegova funkcija v bistvu pospešuje potek različnih vrst kemičnih reakcij v celicah, kar je zelo pomembno za obstoj vseh živih bitij na Zemlji.

Holoencim tvori podpornik in njegova kofaktor/koencim/protetična skupina

Aktivnost številnih encimov je odvisna od identitete in urejanja aminokislin, ki jih sestavljajo, to je od njihovih beljakovinskih struktur in od celovitosti teh struktur v pogojih domačin.

Čeprav to velja za številne encime, obstajajo nekateri, ki za opravljanje svojih funkcij potrebujejo dodatne ne -proteinske elemente. Takšni elementi so znani kot Kofaktorji, Če gre za anorganske ione ali koencimi, Če so to zapletene ali organske molekule.

Na splošno so kofaktorji in koencimi povezani z relativno stabilnostjo beljakovinske strukture encimov, katerih katalitična aktivnost spodbuja; Ko je ta povezava trajna (kovalentna), so te skupine takrat znane kot Protetične skupine.

Primeri podpore

3D ilustracija DNK polimeraze

Aktivni encimski niz, ki ga tvori protein s katalitično aktivnostjo in njegovo kofaktorjo/koencim/protetično skupino Holoencim tudi konjugirani encim. V holoencimu beljakovinski del ustreza tistemu, kar je znano kot podpora ali apoprotein, ki nima aktivnosti.

Primeri nekaterih pomembnih podpor so:

• Encim DNK polimeraza, Odgovoren za ponovitev celične DNK, brez dvovalentnega magnezijevega iona, ki služi kot kofaktor.
• Encim Karbonska anhidraza, zadolžen za kataliziranje pretvorbe Co₂ in H₂0 v bikarbonat in H+ione, brez dvovalentnega cinka, ki služi kot kofaktor.
• Encim hemoglobin, zadolžen za prevoz kisika znotraj rdečih krvnih celic (eritrocitov) s krvjo živali sesalcev, brez njihove protetične skupine hemo.
• Encim laktat dehidrogenaza, zadolžen za proizvodnjo laktata iz Pyruvate, brez NADH, ki služi kot kofaktor.

Lahko vam služi: neolamarckismo: ozadje in značilnosti

Značilnosti apoencimov

Podpora so neaktivni encimi, ki jih potrebujejo, da bi dosegli svojo aktivacijo, zvezo kofaktorja ali koencima, ki pa niso združeni za enega.

Ob upoštevanju tega lahko rečemo, da imajo takšne molekule določene značilnosti, in sicer:

So beljakovine

Za razliko od kofaktorjev in koencimov, ki so neprotenski elementi, potrebni za funkcije holoencimov, so podpora beljakovine.

Prejšnja izjava se torej razume, da podpor tvorijo verige posebnih molekul, znanih kot aminokisline, ki so povezane z vrsto povezave, znane kot peptidna vez.

Aminokislinsko zaporedje vsake podpore je genetsko določeno in to pa pogojuje njegov prostorski ali tridimenzionalni vrstni red, tesno povezan s specifičnostjo substratov, združitev s kofaktorji/koencimi/protetičnimi skupinami, vzpostavitev aktivnega mesta, aktivno mesto, itd.

Kot beljakovine imajo tudi apoencimi: električni naboj, ki ga določa njihova vsebnost aminokislin in pH medija, kjer jih najdemo; Zahteve za temperaturo, pH in ionske sile, ki lahko v prisotnosti kofaktorjev delujejo pri njihovi optimalni hitrosti; zaviralci in konkurenti itd.

Se lahko pridružijo podlagah

Čeprav sami po sebi ne morejo katalizirati encimske reakcije, mnogi podporniki ohranijo sposobnost, da se pridružijo substratom, ki sodelujejo v reakciji, ki jih označuje; Zaradi tega se običajno uporabljajo v nekaterih eksperimentalnih okoliščinah.

Se lahko pridružijo kofaktorjem, koencimom ali protetičnim skupinam

V večini primerov lahko podpore štejemo za neaktivne encime, ki so pripravljen Če se želite pridružiti tistim molekulam, ki se udeležujejo njihovih funkcij, to je: njihovim kofaktorjem, koencimom ali protetičnim skupinam.

Lahko vam služi: flora in favna ekvadorske obale

Kofaktorji lahko neposredno sodelujejo v katalitičnih reakcijah ali preprosto prispevajo k stabilizaciji splošne strukture holoencima.

Med glavnimi kofaktorji, ki sodelujejo v celičnih holoencimih, so:

- Železo (fe2+)

- Baker (Cu2+)

- Kalcij (Ca2+)

- Cink (Zn2+)

- Magnezij (mg2)

- Mangan (MN2+)

- Kobalt (co)

- Nikelj (ni)

Med glavne koencime je mogoče imenovati:

- Vitamini: B9, B3, C

- Adenosín triffosfat (ATP)

- Flavín adenín dinukleotid (FAD)

- Nikotinamid ali Nicotín dinukleotid Dycleotid (NAD)

Struktura piridoksal-fosfata (vir: Ayacop, javna domena, prek Wikimedia Commons)

Nekatere pomembne protetične skupine so:

- Hemo skupina

- Biotin

- Tiaminski pirofosfat

- Piridoksalno-fosfat

Funkcije subenzimov

Ker so nosilci beljakovinski deli holoencimov, jih je pošteno obravnavati kot njihov najpomembnejši del. Tudi ob prisotnosti ustreznih koencimov, koencimov in substratov brez nosilcev ni bilo mogoče izvesti nobene encimske reakcije, ki jih katalizirajo ti encimi.

V tem smislu je glavna funkcija podpore prispevati tako glavno strukturo holoencima, ki ji pripada, kot mesto zveze za kofaktor, koencim in/ali protetično skupino ter substrati, ki sodelujejo v reakciji.

S konstrukcijskega vidika holoencim brez njegovega apoencima ni nič drugega kot kofaktor, kofaktor katalitična reakcija, ki ji pomagajo omenjeni neproprotejski elementi.

Vam lahko služi: Actinomycetes

Tako so funkcije podpore, čeprav gre za neaktivne encime, odvisne od:

- Njegova linearna veriga aminokislin ali primarne strukture (če gre za encimske komplekse, ki jih tvori več kot ena podenota, potem bi o njem razpravljali o "njihovih linearnih verigah").

- Način, kako se te verige naročijo v vesolju, torej sekundarne, terciarne in kvartarne strukture.

- Pravilna konformacija mest, ki so temeljna za katalizo, to je katalitično mesto z aminokislinami, ki sodelujejo v reakciji, na mestu sindikata za co -encime, koencime ali protetične skupine; itd.

- Stabilnost strukture v celičnih pogojih oz domačin, dejstvo, ki je neposredno povezano s sposobnostjo apoencima, da tvori holoencim, in druge.

Reference

1. Boyer, str. D., & Krebs in. G. (1986). Encimi. Akademski tisk.
2. Garrett, r. H., & Grisham, c. M. (2001). Načela biokemije: s človeškim fokusom. Založba Brooks/Cole.
3. Gruber, k., Puffer, b., & Kräutler, b. (2011). Vitamin B 12-derivacijsko-encimski so-faktorji in ligandi beljakovin in nukleinskih kislin. Pregledi kemijskega društva, 40 (8), 4346-4363.
4. Murray, r. K., Granner, d. K., Mayes, str. Do., & Rodwell, v. W. (2014). Harperjeva ilustrirana biokemija. McGraw-Hill.
5. Nelson, d. L., Lehninger, a. L., & Cox, m. M. (2008). Lehningerjeva načela biokemije. Macmillan.
6. Staiano, m., Pennacchio, a., Varriale, a., Capo, a., Majoli, a., Cappachchione, c., & D'Auria, s. (2017). Encimi kot senzorji. V metodah v encimologiji (vol. 589, str. 115-131). Akademski tisk.