Ribcimi

Kaj so ribzimi?

The Ribcimi So RNA (ribonukleinska kislina) s katalitično sposobnostjo, ki lahko pospeši kemične reakcije, ki se pojavijo v telesu. Nekateri ribzimi lahko delujejo sami, drugi pa potrebujejo prisotnost beljakovin za izvajanje katalize.

Doslej odkrita rebrast sodelujejo pri generiranju reakcij prenosnih molekul RNA in v reakcijah Spajanje: Transerifikacija, ki sodeluje pri izločanju intronov iz molekul RNA, bodisi messenger, prenos ali ribosomalno. Glede na njihovo funkcijo so razvrščeni v pet skupin.

Odkritje ribcimov je vzbudilo zanimanje številnih biologov. Te katalitične RNA so bile predlagane kot potencialni kandidat za molekule, ki so morda povzročile prve načine življenja.

Poleg tega mnogi virusi uporabljajo RNA kot genetski material in mnogi so katalitični. Zato ribzimi ponujajo priložnosti za ustvarjanje drog, ki si prizadevajo za napad na te katalizatorje.

Značilnosti katalize

- Ribzimi so katalitične molekule RNA, ki lahko pospešijo prenosne reakcije fosforilne skupine pri redah velikosti 10⁵ do 10^enajst.

- V laboratorijskih poskusih so se tudi dokazali, da sodelujejo v drugih reakcijah, kot je transterifikacija fosfata.

Vrste ribzimov

Obstaja pet razredov ali vrst ribzimov: trije sodelujejo v reakcijah samopomedovanja, medtem ko preostali dve (ribonukleaza P in ribosomalna RNA) v katalitični reakciji uporabljata drugačen substrat.

Z drugimi besedami, molekula, ki se razlikuje od katalitične RNA.

Introni skupine I

To vrsto intronov so našli v mitohondrijskih genih zajedavcev, gliv, bakterij in celo virusa (kot je bakteriofag T4).

Na primer v protozoanu vrste Tetrahymena Thermofila, Intron se izloči iz predhodnika ribosomske RNA v nizu korakov: najprej se nukleotid ali gvanozin nukleozid reagira s fosfodiestersko vez, ki se pridruži intronu z eksonsko -transterifikacijo tranzicije eksona-.

Nato prosti ekson naredi enako reakcijo v povezavi Exon-Intrón Fosphodi-Intrón na koncu skupine intronov Acceptor Group.

Introni skupine II

Introni skupine II so znani kot "samo -poslovanje", saj so te RNK sposobne za samostojno sezono. Introni te kategorije najdemo v predhodnikih mitohondrijske RNA v rodu gliv.

Skupine I in II ter ribonukleaze P so ribcime, za katere je značilno, da so velike molekule, ki lahko dosežejo do nekaj sto nukleotidov v dolžini in tvorijo zapletene strukture.

Introni skupine III

Introni skupine III se imenujejo "samodejno" RNA in so bili identificirani v rastlinskih patogenih.

Te RNA imajo posebnost, da se lahko režejo v reakciji zorenja genomskih RNA, ki temeljijo na predhodnikih z mnogimi enotami.

V tej skupini je eden najbolj priljubljenih in preučenih ribzmimov: glava kladiva ribozuma. To najdemo v nalezljivih ribonukleičnih sredstvih zelenjave, imenovanih viroidi.

Ti povzročitelji zahtevajo, da se postopek samousjenja širi in izdela več kopij sebe v neprekinjeni verigi RNA.

Viroidi morajo biti ločeni drug od drugega in to reakcijo katalizira zaporedje RNA, ki ga najdemo na obeh straneh Unije.

Eno od teh sekvenc je "glava kladiva" in se tako imenuje podobnost njegove sekundarne strukture s tem instrumentom.

Ribonuclease p

Četrto vrsto ribcimov tvorijo molekule RNA in beljakovine. V ribonucleas je struktura RNA ključnega pomena za izvedbo katalitičnega procesa.

V celičnem okolju ribonukleaza P deluje enako kot beljakovinski katalizatorji, pri čemer rezate prenos prenos RNA, da bi ustvarili 5 'zrel konec.

Ta kompleks lahko prepozna razloge, katerih zaporedja se med evolucijo niso spremenila (ali so se zelo malo spremenila) predhodnikov prenosne RNA.

Za združevanje substrata z ribcimom ne uporablja komplementarnosti med bazami.

Se razlikujejo od prejšnje skupine (ribzymes hammer glava) in RNA, podobne temu, do končnega produkta reza: ribonukleaza proizvaja 5 'fosfatni konec.

Bakterijski ribosom

Študije ribosome strukture bakterij so nam omogočile sklenitev, da ima tudi lastnosti ribzima. Mesto, zadolženo za katalizo, se nahaja v podenoti 50. let.

Evolucijske posledice ribcimov

Odkritje RNA s katalitičnimi sposobnostmi je povzročilo hipoteze, povezane z izvorom življenja in njenim razvojem v začetnih fazah.

Ta molekula je osnova hipoteze "primitivnega sveta RNA". Več avtorjev podpira domnevo, da se je moralo življenje pred milijardami let začeti z določeno molekulo, ki je imela sposobnost katalizacije lastnih reakcij.

Tako se zdi, da so ribzimi potencialni kandidati za te molekule, ki so nastale na prvih načinih življenja.

Reference

1. Devlin, t. M. Biokemija: učbenik s kliničnimi aplikacijami. Sem se obrnil.
2. Strobel, s. Do. Ribozim/katalitična RNA. Enciklopedija molekularne biologije.
3. Voet, d., Voet, J. G., & Pratt, c. W. (2014). Osnove biokemije. Ed. Pan -american Medical.