Značilnosti genotip, reakcijski standard, določitev

On genotip Opredeljen je kot niz genov (z njihovimi aleli), ki ga kodirajo za določeno značilnost ali značilnost, ki jih od drugih razlikuje po določeni funkciji ali zaporedju. Vendar pa ga nekateri avtorji tudi opredelijo kot del genoma, ki povzroča fenotip ali kot alelno ustavo organizma.

Čeprav so povezani, izraza genotip in fenotip nista ista stvar. V tem smislu je fenotip opredeljen kot niz vidnih značilnosti organizma, ki so posledica izražanja njegovih genov, in genotipa kot nabor genov, ki ima za posledico določen fenotip.

Genotip in fenotip (vir: Nacionalni inštitut za raziskave človeškega genoma [javna domena] prek Wikimedia Commons) je genotip le eden od dejavnikov, ki sodelujejo pri vzpostavljanju fenotipa, saj vpliv okolja in drugih epigenetskih elementov, ki niso neposredno povezani v nukleotidno zaporedje oblikuje tudi vidne značilnosti posameznikov.

Tako imata dva organizma enak genotip, če imata iste genske sklope, vendar enako ne velja za dva organizma, ki imata očitno isti fenotip, saj so lahko podobne značilnosti produkt različnih genov.

Danski botanik Wilhelm Johansen je bil leta 1909 v učbeniku, ki ga je naslovil "Elementi teorije o natančni dediščini ", ki je bil produkt niza poskusov, ki so izvajali prečkanje čistih linij ječmena in graha.

Njegova dela, ki jih je verjetno navdihnil tisti, ki jih je nekaj let prej naredil Gregorio Mendel, ki jih obravnava kot "Oče genetike”, Mu je omogočil, da pojasni, da genotip organizma povzroča fenotip z različnimi razvojnimi procesi in pod vplivom okolja.

[TOC]

Značilnosti

Genotip ni popolnoma enak genomu. Tu je razlikovanje med obema konceptoma:

- "Genome" se nanaša na vse gene, ki jih je posameznik podedoval od svojih staršev in kako se distribuirajo v kromosomih znotraj jedra.

- "Genotip" je izraz, ki se uporablja na primer na nabor genov in njihove različice, ki povzročajo določeno značilnost, da se posameznik loči znotraj populacije ali vrste.

Čeprav je nagnjen k spremembam zaradi mutacij v celotni življenjski zgodovini organizma, je genotip razmeroma nespremenljiva značilnost posameznikov, saj so teoretični geni, ki so podedovani.

V naravni populaciji imajo aleli, ki sestavljajo dani genotip, različne frekvence videza; To pomeni, da se nekateri pojavljajo v populacijah bolj kot drugi in to se nanaša med nekatere stvari, z distribucijo, okoljskimi pogoji, prisotnostjo drugih vrst itd.

Izraz "genotip divji"Določi prvo alelno varianto, ki jo najdemo v naravi, vendar se ne nanaša nujno na alel, ki ga najdemo pogosteje v populaciji; in izraz "genotip Mutant"Trenutno se uporablja za opredelitev tistih alelov, ki se razlikujejo od divjine.

Za napis genotipa se običajno uporabljajo velike črke in male črke, da se razlikujejo med aleli, ki jih ima posameznik, bodisi homozigotični ali heterozigotni. Kapitalske črke se uporabljajo za določitev prevladujočih in malih črtnih alelov za recesije.

Pravilo reakcije genotipa

Posamezniki podedujejo gene svojih staršev, ne pa končnih izdelkov, ki jih dobimo iz njihovega izražanja, ker so odvisni od številnih zunanjih dejavnikov in zgodovine njihovega razvoja.

V skladu s tem in na podlagi okoljskih dejavnikov lahko genotip privede do več kot enega fenotipa. Nabor možnih "rezultatov" interakcije določenega genotipa z različnimi okolji je tisto, kar so znanstveniki poimenovali "pravilo genotipa reakcije".

Reakcijska norma genotipa je torej nekakšna "kvantifikacija" ali registracija vidnih značilnosti, pridobljenih iz interakcij genotipa z določenimi okolji. Lahko se izrazi kot grafika ali tabele, ki "napovedujejo" možne rezultate.

Seveda je očitno, da se reakcijski standard nanaša le na delni genotip, delni fenotip in nekaj okoljskih dejavnikov, saj je v praksi zelo težko napovedati absolutno vse interakcije in vse rezultate teh teh.

Kako se določa genotip?

Določite genotip ali "genotipificirajte" organizem ali populacijo posameznikov iste vrste, ponuja veliko dragocenih informacij o njegovi evolucijski biologiji, svoji populacijski biologiji, njegovi taksonomiji, njegovi ekologiji in njeni genetski raznolikosti.

V mikroorganizmih, kot so bakterije in kvasovke, saj imajo večjo množenje in mutacije kot večina večceličnih organizmov, določanje in poznavanje genotipa omogoča nadzor identitete kolonij v zbirkah, pa tudi določi nekatere značilnosti epidemiologije, ekologije in taksonomije istega.

Za določitev genotipa je treba pridobiti vzorce organizma, s katerim želite delati, in potrebne vrste vzorcev bodo odvisne od vsakega organizma. Pri živalih lahko na primer jemljemo vzorce različnih tkiv: rep, ušesa, iztrebki, lase ali kri.

Genotip organizma je mogoče eksperimentalno določiti zaradi uporabe nekaterih sodobnih tehnik, ki bodo odvisne od genomske lokacije genov za preučevanje, proračun in časa, enostavnosti uporabe in stopnje zaželene učinkovitosti.

Trenutno tehnike, ki se uporabljajo za genotipifikacijo organizma.

Več markerjev zaposlenih

Med najbolj uporabljenimi označevalci najdemo naslednje:

- Rflps (polimorfizmi restrikcijskih fragmentov).

- AFLP (ojačani polimorfizmi dolžine fragmentov).

- RAPD (naključno ojačana polimorfna DNK).

- Mikrosateliti ali SSR (ponavljajoče preprosto zaporedje).

- ASAPS (osnovni premazi, povezani s specifičnimi aleli).

- SNP (preprosti nukleotidni polimorfizmi).

Tehnike, ki uporabljajo zaporedje in hibridizacijo

Med tehnikami, ki uporabljajo specifično sekvenciranje in hibridizacijo določenih sond, so:

- Zaporedje po Sangerjevi metodi.

- Visokozmogljiva genotipifikacija.

- Vaja "Zlata vrata”Iz Illumine.

- Sekvenciranje genotipifikacije (GBS).

- Taqmanski esej.

- Zaporedje nove generacije.

- Mikroareri.

- Popolno zaporedje genoma.

Reference

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, d., & Miller, J. (2005). Uvod v genetsko analizo (8. izd.). Freeman, w. H. & Podjetje.
2. Klug, w., Cummings, m., & Spencer, c. (2006). Koncepti genetike (8. izd.). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, str.-In. (2001). Metode za genotipizacijo enojnih nukleotidnih polimorfizmov. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet., 2(11), 235–258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Kaj natančno so genomi, genotipi in fenotipi? Kaj pa pojave ? J. Teoor. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, l. L. (1999). AFLP genotipizacija in odtis prsta. Drevo, 14(10), 389–394.
6. Nacionalni inštitut za zdravje. Pridobljeno 14. maja 2019 z www.ameriški nacionalni inštitut za zdravje.Gov/
7. Patel, d. Do., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Napredek v genotipizaciji rastlin: Kadar nas bo vodila prihodnost. V j. Batley (ed.), Rastlinska genotipizacija: Metode in protokoli (Vol. 1245, str. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, b. (2012). Genetika: konceptualni pristop. Freeman, w. H. & Podjetje.
9. Schleif, r. (1993). Biologija genetika in molekularna (2. izd.). Maryland: The Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, b. (2014). Metode genotipizacije. V. Filloux & J. L. Ramos (eds.), Metode v molekularni biologiji (Vol. 1149, str. 33-47). New York.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, q., Lin in., & Fang, m. (2013). Pregled o razvoju metod genotipizacije za oceno raznolikosti kmetijskih živali. Journal of Animal Science and Biotechnology, 4(2), 2-6.