Funkcije in funkcije Tata Box

The Tata škatla, V celični biologiji gre za konsenzusno zaporedje DNK, ki ga najdemo v vseh rodovih živih organizmov in je široko ohranjen. Zaporedje je 5'-tataaa-3 'in lahko sledi nekaj ponavljajočih se adeninov.

Lokacija škatle je zgoraj (ali reka zgoraj, kot se običajno imenuje v literaturi) začetka transkripcije. To se nahaja v promotorju genov, kjer se bo pojavila zveza s transkripcijskimi faktorji. Poleg teh dejavnikov se RNA polimeraza II običajno pridruži škatli Tata.

RNA polimeraza II. Vir: Fvasconcellos 21:15, 14. november 2007 (UTC) [javna domena]

Čeprav je škatla Tata glavno zaporedje promotorja, obstajajo geni, ki ga nimajo.

[TOC]

Značilnosti

Začetek sinteze RNA zahteva, da se RNA polimeraza združi s specifičnimi sekvencami DNK, imenovane promotorji. Tata caja je soglasno zaporedje promotorja. Imenuje se pribiew Box v prokarioti in Goldberg-Hogness Box v evkariotih.

Tako je škatla Tata regija, ohranjena v DNK. Sekvenciranje številnih regij začetka transkripcije DNK je pokazalo, da je konsenzusno zaporedje ali skupno zaporedje (5ʾ) t*a*taat*(3ʾ). Položaji, označeni z zvezdico, imajo visoko homologijo. Zadnji t ostanki so vedno v promotorjih In. coli.

Lokacija škatle Tata v prokariotah

Po konvenciji so osnovni pari, ki ustrezajo začetku sinteze molekule RNA. Škatla Tata je v regiji -10.

Vam lahko služi: eritroblasti: kaj so eritropoeza, povezane patologije

V In. coli, Promocijska regija je med položaji -70 in +30. V tej regiji je drugo konsenzusno zaporedje (5ʾ) t*tg*aca (3ʾ) v položaju -35. Prav tako imajo položaji, označeni z zvezdico.

Lokacija škatle Tata v evkariotih

V evkariotih imajo promocijske regije signalne elemente, ki se razlikujejo za vsako od polimerazne RNA. V In. coli Ena sama polimerazna RNA identificira signalne elemente v promocijski regiji.

Poleg tega so v evkariotih promocijske regije bolj razširjene. Obstajajo različne sekvence, ki se nahajajo v regiji -30 in -100, ki vzpostavljajo različne kombinacije v različnih promotorjih.

V evkariotih obstajajo številni transkripcijski faktorji, ki delujejo s promotorji. Na primer, faktor TFIID se veže na zaporedje TATA. Po drugi strani so geni ribosomskih RNA strukturirani v obliki več genov, eden pa sledi drugi.

Razlike v konsenzusovih zaporedjih regij -10 in -35 spremenijo združitev RNA polimeraze v območje promotorja. Tako mutacija z enim bazo povzroči zmanjšanje hitrosti zveze polimeraze na območje promotorja.

Funkcije

Transkripcijski papir

Škatla Tata sodeluje v zvezi in iniciaciji prepisovanja. V In. coli, Holoencim RNA polimeraza sestavljajo pet α podenot₂ββσ. Σ podenota se pridruži DNK dvojne verige in se premika v iskanju polja Tata, kar je signal, ki ga označuje začetek gena.

Kako pride do prepisovanja?

Podenota σ RNA polimeraze ima zelo visoko konstanto povezanosti s promotorjem (v vrstnem redu 10^enajst), ki kaže na visoko specifičnost prepoznavanja med njim in zaporedjem polja Pribiew.

Lahko vam služi: Langerhansove celice: značilnosti, morfologija, funkcije

RNA polimeraza se pridruži promotorju in tvori zaprt kompleks. Nato tvori odprt kompleks, za katerega je značilno lokalno odprtino 10 osnovnih parov dvojnega propelerja DNA. Ta odprtina je olajšana, ker je zaporedje Pribiew Box bogato z A-T.

Ko se DNK odvije, se oblikuje prva fosfodiésterska povezava in se začne elantacija RNA. Podenota σ se sprosti in RNA polimeraza opusti promotor. Druge molekule RNA polimeraze se lahko pridružijo promotorju in začnejo transkripcijo. Na ta način je mogoče večkrat prepisati gen.

V kvasovkah RNA polimeraza II sestavlja 12 podenot. Ta encim začne transkripcijo, ki prepozna dve vrsti konsenzusnih zaporedij na 5ʾ koncu začetka transkripcije, in sicer: Tata Consensus; CAAT konsenzus zaporedje.

Faktorji transkripcije

RNA polimeraza II potrebuje protein, imenovan transkripcijski faktorji TFII, da bi tvorili aktivni transkripcijski kompleks. Ti dejavniki so precej ohranjeni v vseh evkariotih.

Transkripcijski faktorji so beljakovinske molekule, ki se lahko pridružijo molekuli DNK in imajo možnost, da povečajo, zmanjšajo ali prekličejo proizvodnjo določenega gena. Ta dogodek je ključnega pomena za regulacijo genov.

Trgovanje transkripcijskega kompleksa se začne z vezavo proteina TBP ("tata-vezavni protein") na tata caja. Ta protein pa veže TFIIB, ki se tudi veže na DNK. Kompleks TBP-TFIIB se pridruži še enemu kompleksu, ki ga tvorita TFIIF in RNA polimeraza II. Na ta način TFIIF pomaga RNA polimeraza II, da se pridruži promotorju.

Vam lahko služi: lenticela

Na koncu se TFIIE in TFIIH pridružita in ustvarita zaprt kompleks. TFIIH je helosa in spodbuja ločitev dvojne verige DNK, procesa, ki ga potrebuje ATP. To se zgodi blizu začetka sinteze RNA. Na ta način se oblikuje odprt kompleks.

Transkripcijski faktorji in rak

P53 Protein je transkripcijski faktor, znan tudi kot protein tumorja p53. Je produkt prevladujočega raka. Li-Francoi sindrom nastane s kopijo tega mutiranega gena, ki povzroča videz karcinomov, levkemije in tumorjev.

Znano je, da p53 zavira transkripcijo nekaterih genov in aktivira prepisovanje drugih. Na primer, p53 preprečuje transkripcijo genov s promotorjem Tata s tvorbo kompleksa, ki ga tvori p53, drugi transkripcijski faktorji in promotor tata. Tako p53 ohranja rast celic pod nadzorom.

Reference

1. Bohinski, r. 1991. Biokemija. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, Delaware.
2. Lodish, h., Berk, a., Zipurski, s.L., Matsudaria, str., Baltimore, d., Darnell, J. 2003. Celična in molekularna biologija. Pan -ameriški medicinski uvodnik, Buenos Aires.
3. Prijatelj, s. 1994. P53: pogled na lutko za igro v senci. Science, 265: 334.
4. Devlin, t.M. 2000. Biokemija. Uredništvo Reverté, Barcelona.
5. Voet, d., Voet, J. 2004. Biokemija. Jonh Wiley in Sons, New York.
6. Nelson, d. L., Cox, m. M. 2008. Lehning-principles biokemije. W.H. Freeman, New York.