Etidijeva bromidna struktura, lastnosti, uporabe, toksičnost

On Etidni bromid To je fluorescentna in aromatična spojina, ki ima sposobnost zaradi svoje kemijske strukture prepletanja med verigami DNK. Prav tako se veže na zelo zložene molekule RNA. To omogoča interakcijo med to soljo in bazami dušika.

Etidijev bromid absorbira ultravijolično svetlobo v različnih valovnih dolžinah med 210 nm in 285 nm, kar oddaja oranžno fluorescenco 605 nm. Intenzivnost njegove fluorescence se poveča do 20 -krat, ko deluje z DNK.

DNK obarvanje z etidijevim bromidom fluorescentno pod UV sevanjem v agaroznem gelu. Vir: Šola za naravne vire iz Ann Arbor [CC by (https: // creativeCommons.Org/licence/by/2.0)]

Zaradi lastnosti fluorescence se etidijev bromid uporablja za vizualizacijo ločenih fragmentov DNK s pomočjo agarozne elektroforeze (vrhunska slika); Tehnika, ki sta jo neodvisno uvedla AAIJ in BORST (1972) in Sharp (1973).

Etidijev bromid pri prepletu med verigami DNK bi lahko tudi oviral njegove procese podvajanja in transkripcije; In zato je vzrok za nastajanje mutacij. Vendar ni dokončnih dokazov, ki dokazujejo to domnevo.

[TOC]

Kemična struktura

Molekularna struktura etidijevega bromida. Vir: Calvero. [Javna domena]

Na vrhunski sliki imamo molekularno strukturo etidijevega bromida, ki jo predstavlja njegova strukturna formula.

Molekula je skoraj popolnoma ravna, ker vsi atomi sistema, ki jih tvorijo trije obroči (fantridin) in pozitivno obremenjeni dušikov atom, imajo hibridizacijo sp². Vendar se s svojimi nadomestnimi skupinami ne dogaja na enak način.

Fenilna skupina desnega konca, amino skupine in etilna skupina, povezana z naloženim dušikom.

Vam lahko služi: Faraday Constant

Po drugi strani opazite, da njegove medmolekularne interakcije urejajo predvsem elektrostatične znamenitosti; In v manjši meri ostajajo kohezivne zaradi disperzivnih sil obročev.

Lastnosti

Ime

Etidni bromid.

IUPAC Ime: 3,8-Diamino-5-Etil-6-Fenilfenantridino Bromuro.

Sinonime: homidio in dromilac bromid.

Molekularna formula

C_enaindvajsetH_dvajsetN₃Br

Fizični videz

Temno rdeči kristali ali je predstavljen kot rjav prah.

Okus

Grenka.

Vonj

Trdno WC.

Tališče

260 - 262 ° C (razpade).

točka vžiga

> 100 ° C

Topnost

40 g /l a 25 ° C v vodi in v etanolu 2 mg /ml.

Gostota

0,34 g / cm³

Parni tlak

1.2 · 10^-12 MMHG pri 25 ° C (ocenjeno).

Koeficient oktanola/vode

Dnevnik kow = - 0,38

Razgradnja

Ko se etidijev bromid segreje na razgradnje, oddaja zelo strupeni vodikov bromid in dušikovi oksidi.

Stabilnost

Stabilno in nezdružljivo z močnimi oksidacijskimi sredstvi.

Lomni količnik

1,67 (ocenjeno).

ph

4 - 7 v 2 % raztopini v vodi.

Prijave

Verižna reakcija polimeraze (PCR)

Verižna reakcija polimeraze, PCR, vam omogoča, da pridobite številne kopije eksponentno na podlagi fragmenta DNK. Tehnika temelji na lastnosti encima DNK polimeraze, da bi ponovili pramene DNK iz njegovih fragmentov, ki služijo kot plesen.

Gre za tehniko, ki ima nešteto aplikacij, vključno z odkrivanjem mutacij, povezanih z dednimi boleznimi; Očetovski testi; Identifikacija osebe, ki je storila kaznivo dejanje itd.

Etidijev bromid pomaga pri identifikaciji fragmentov DNK, produktih njegove encimske razgradnje, ki jih je mogoče uporabiti v tehniki PCR.

DNK elektroforeza v gelu agaroze in akrilamida

Etidijev bromid je prej vgrajen v gel elektroforeze. Spojina je prepletena med pasovi DNA in proizvaja fluorescenco, kadar je izpostavljena ultravijolični svetlobi, ki služi za prikaz fragmentov DNK, ki se ločijo v elektroforezo.

Lahko vam služi: metode ločevanja heterogenih mešanic

Vzorec fluorescence elektroforeze služi za orientacijo o izvoru fragmentov DNK. Zveza etidijevega al DNA bromida spreminja konformacijo, obremenitev, teža in prožnost molekule DNK, kar pomeni zmanjšanje mobilnosti makromolekule.

Ta učinek se poveča, ko se velikost fragmenta DNK povečuje.

Akcija etidnega bromida na Tripnomas

Etidijev bromid se je začel uporabljati pri zdravljenju govedo triposomiaze v petdesetih letih prejšnjega stoletja z imenom Homidio. Od tam se je ime homide bromid pojavilo kot sinonim za etidijev bromid.

Terapevtska uporaba etidijevega bromida temelji na njegovi toksičnosti za mitohondrije. To se kaže z zmanjšanjem števila kopij mitohondrijske DNK.

Etidijev bromid se veže na molekule DNK kinetoplasta Tripansome in spremeni njegovo konformacijo v DNAZ. Ta oblika DNK je smrtonosna, saj je njegova replikacija zavirana.

Uporabite v modelu multiple skleroze pri živalih

Neposredna etidska injekcija bromida v cisterni Magna je povzročila akutno izgubo izgube ponovljivega mielina v možganskem steblu podgan.  Enaka injekcija hrbtenjače mačk je povzročila poškodbo, primerljivo s tistimi, ki so jih opazili pri podganah.

Multipla skleroza je avtoimunska bolezen živčnega sistema, v kateri imunski sistem proizvaja uničenje mielina, snovi, ki pokriva nevrone.

Vam lahko služi: klor: zgodovina, lastnosti, struktura, tveganja, uporabe

Strupenost

Izpostavljenost

Etidijev bromid velja za strupeno spojino, saj z vdihavanjem povzroči akutno draženje dihalnega trakta. Tudi s stikom s kožo lahko etidijev bromid povzroči vnetje in/ali razbarvanje.

Medtem v očeh akutna izpostavljenost povzroči draženje, pordelost in bolečine. Zato je priporočljivo, da se material, ki se uporablja z etidijevim bromidom, ravna z varnostnim listom materiala (MSDS).

Mutageni značaj

Etidijev bromid ima kot zelo mutagena spojina, saj lahko med interkaliranjem v DNK vpliva na njegovo podvajanje in transkripcijo, kar povzroči mutacije; In celo možno rakotvorno delovanje je bilo poudarjeno.

Amesov test je indukcijo mutacij odkril le z etidijevim bromidom pri bakterijah, ko smo pri preskusu uporabili homogenizirano jeter.

To je nakazovalo, da ni neposredno odgovoren za pojav mutacij v bakterijah, ampak da bi to lahko bila posledica delovanja presnove, ki nastane pri interakciji etidio bromida s homogeniziranimi jetri.

Po drugi strani je naravni toksikološki program ugotovil, da etidijev bromid ni mutagest za podgane in miši. Kljub temu se njegova uporaba zmanjšuje v laboratorijih, ki jo uporabljajo pri njihovih raziskavah.

Vendar pa je koncentracija etidijevega bromida, ki se uporablja v preiskavah.

Reference

1. Doronina Vicki. (2017). Burning Bright: Kratka zgodovina obarvanja DNK etidijevega bromida. Okrevano od: BitesizeBio.com
2. Wikipedija. (2020). Etidijev bromid. Pridobljeno iz: v.Wikipedija.org
3. Elsevier b.V. (2020). Etidijev bromid. Znanstveno. Pridobljeno iz: SCINCEDIRECT.com
4. Royal Society of Chemistry. (2020). Etidijev bromid. Okreval od: chemspider.com
5. Kemijska knjiga. (2017). Etidijev bromid. Obnovi se od: Kemicalbook.com
6. Politehnična univerza v Valenciji. (2012). Standardni postopek za delo z etidijevim bromidom. Okrevano od: SPRL.UPV.je